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pandas:如何保存数据比较好?

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我们在使用pandas处理完数据之后,最终总是要把数据作为一个文件保存下来,
那么,保存数据最常用的文件是什么呢?
我想大部分人一定会选择csv或者excel。
刚接触数据分析时,我也是这么选择的,不过,今天将介绍几种不一样的存储数据的文件格式。
这些文件格式各有自己的一些优点,希望本文能让你以后的数据存储方式能有不一样的选择,从而存储的更加专业。
1. 准备数据

本次使用的数据来自A股2023年全年的日交易数据。
数据下载地址:https://databook.top/。
导入数据:
  1. import pandas as pd
  2. fp = "d:/share/历史行情数据-不复权-2023.csv"
  3. df = pd.read_csv(fp)
  4. df
复制代码

总共大约120多万条数据。
准备好测试数据之后,开始测试各种文件的效果。
2. CSV

使用pandas做数据分析时,保存数据最常用的格式一定是CSV(或者excel)。
因为CSV格式易于分享,用excel或者文本编辑器都能直接打开。
但是当数据集规模比较大时,它的磁盘利用率和读写效率究竟如何呢?
首先我们把准备的数据保存为一个测试用的test.csv文件。
  1. df = pd.read_csv(fp)
  2. df.to_csv("d:/share/test.csv", index=None)
复制代码
看看文件大小:
  1. ls .\test.csv
  2.     目录: D:\share
  3. Mode                 LastWriteTime         Length Name
  4. ----                 -------------         ------ ----
  5. -a----        2024/03/15  10:41:27      101411037 test.csv
复制代码
test.csv文件大约:\(101411037/1024/1024 \approx 96.7MB\)
读取效率:
  1. %%timeit
  2. df = pd.read_csv("d:/share/test.csv")
复制代码
  1. 1.73 s ± 54.7 ms per loop (mean ± std. dev. of 7 runs, 1 loop each)
复制代码
写入的效率:
  1. %%timeit
  2. df.to_csv("d:/share/test.csv", index=None)
复制代码
  1. 13.2 s ± 402 ms per loop (mean ± std. dev. of 7 runs, 1 loop each)
复制代码
3. Pickle

Pickle格式是一种用于序列化和反序列化Python对象结构二进制格式
它的主要特点是能够将程序中运行的对象信息保存到文件中。
下面,我们先把准备的数据保存为一个测试用的test.pkl文件。
  1. # pickle file
  2. df = pd.read_csv(fp)
  3. df.to_pickle("d:/share/test.pkl")
复制代码
文件大小:
  1. ls .\test.pkl
  2.     目录: D:\share
  3. Mode                 LastWriteTime         Length Name
  4. ----                 -------------         ------ ----
  5. -a----        2024/03/15  10:49:09      116904470 test.pkl
复制代码
test.pkl文件大约:\(116904470/1024/1024 \approx 111.5MB\)
读取效率:
  1. %%timeit
  2. df = pd.read_pickle("d:/share/test.pkl")
复制代码
  1. 136 ms ± 5.09 ms per loop (mean ± std. dev. of 7 runs, 10 loops each)
复制代码
写入效率:
  1. %%timeit
  2. df.to_pickle("d:/share/test.pkl")
复制代码
  1. 182 ms ± 7.42 ms per loop (mean ± std. dev. of 7 runs, 1 loop each)
复制代码
4. Parquet

Parquet格式是一种列式存储格式,被广泛应用于大数据处理领域。
它采用了压缩和编码技术,能够有效地存储和压缩数据,同时保持数据的结构和模式。
下面,我们先把准备的数据保存为一个测试用的test.parquet文件。
  1. # parquet file
  2. df = pd.read_csv(fp)
  3. df.to_parquet("d:/share/test.parquet")
复制代码
文件大小:
  1. ls .\test.parquet
  2.     目录: D:\share
  3. Mode                 LastWriteTime         Length Name
  4. ----                 -------------         ------ ----
  5. -a----        2024/03/15  10:52:08       32964728 test.parquet
复制代码
test.parquet文件大约:\(32964728/1024/1024 \approx 31.4MB\)
读取效率:
  1. %%timeit
  2. df = pd.read_parquet("d:/share/test.parquet")
复制代码
  1. 200 ms ± 8.54 ms per loop (mean ± std. dev. of 7 runs, 1 loop each)
复制代码
写入效率:
  1. %%timeit
  2. df.to_parquet("d:/share/test.parquet")
复制代码
  1. 1.23 s ± 62.4 ms per loop (mean ± std. dev. of 7 runs, 1 loop each)
复制代码
5. Feather

Feather格式是一种高速、轻量且易于使用的二进制文件格式,专门用于存储数据帧。
Feather的主要目标是提供高性能的读写操作。
下面,我们先把准备的数据保存为一个测试用的test.feather文件。
  1. # feather file
  2. df = pd.read_csv(fp)
  3. df.to_feather("d:/share/test.feather")
复制代码
文件大小:
  1. ls .\test.feather
  2.     目录: D:\share
  3. Mode                 LastWriteTime         Length Name
  4. ----                 -------------         ------ ----
  5. -a----        2024/03/15  11:17:15       57347098 test.feather
复制代码
test.feather文件大约:\(57347098/1024/1024 \approx 54.7MB\)
读取效率:
  1. %%timeit
  2. df = pd.read_feather("d:/share/test.feather")
复制代码
  1. 130 ms ± 5.29 ms per loop (mean ± std. dev. of 7 runs, 10 loops each)
复制代码
写入效率:
  1. %%timeit
  2. df.to_feather("d:/share/test.feather")
复制代码
  1. 277 ms ± 14.8 ms per loop (mean ± std. dev. of 7 runs, 1 loop each)
复制代码
6. 总结

pandas能够保存的文件格式有很多,比如还有XML,JSON,HTML等等,
上面列出的4种是我认为比较典型,且在数据分析领域用的比较多的格式。
4种格式的比较总结如下:
磁盘占用读取效率写入效率csv96.7 MB1.73 s ± 54.7 ms13.2 s ± 402 mspickle111.5 MB136 ms ± 5.09 ms182 ms ± 7.42 msparquet31.4 MB200 ms ± 8.54 ms1.23 s ± 62.4 msfeather54.7 MB130 ms ± 5.29 ms277 ms ± 14.8 ms综合来看,当我们的数据量不大的时候,用CSV格式比较好,分享方便,可以用多种编辑器直接打开查看。
当数据规模变大了之后,如果数据需要长期存储,而且不需要经常的更新写入,那么用parquet格式(它的磁盘占用最低,读取性能好,写入性能略逊);
如果只要短期存储的话,用fetdher格式更好(磁盘占用不算高,读写性能都不错)。
至于pickle格式,它的读写性能也不错,但它的最大优势是可以保存python对象的状态,只用来保存数据的话,这个优势难以体现。
而且它的磁盘占用比较大,单纯保存数据的话,不建议使用这种格式。

来源:https://www.cnblogs.com/wang_yb/p/18075201
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