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为了实现不同数据的可视化,最近研究了python环境下的可视化方案,为后续的流体运动仿真模拟做好储备,由于python处理数据的便利性,导致目前很多后端处理或者可视化成图操作都在python中实现,比如前端是vue,加上简单的交互操作,后端搭建webserver,可采用java或者python来搭建,并利用python在后端处理数据,形成可视化图件等;本文主要在python3.10环境下,利用 matplotlib.pyplot、scipy.interpolate、numpy、pandas实现数据的处理,网格数据的生成,各自平面图和三维图形的绘制,并加入自定义颜色栏。在绘图开始之前,需要准备数据,一般包括读取和准备数据,以及简单的数据处理过滤等,后续会在此基础上进行绘图操作或继续进行数据处理及可视化等。
准备数据阶段
- # 准备数据 读取数据
- # 0.读写实际数据生成三维曲面,数据格式为x y z
- filename=r'D:\project\PythonProject\ECL\data\geochemical-data\2018_T28.txt'
- dataTop = pd.read_csv(filename, sep='\t', header=None, names=['x', 'y', 'z'])
- # 去掉无效数据,一般为-99999.0000
- data = dataTop[dataTop['z'] != -99999.0000]
- x = data.iloc[:, 0]
- y = data.iloc[:, 1]
- z = data.iloc[:, 2]*(-1) #深度值是负数,要取反。
- xi = np.linspace(min(x), max(x))
- yi = np.linspace(min(y), max(y))
- xi, yi = np.meshgrid(xi, yi) # 将一维数据处理为二维的网格数据
- zi = griddata(data.iloc[:,0:2], z, (xi, yi), method='cubic') # 用法详见附录1
复制代码 2018_T28.txt文件内容
读取后的数据样式,xyz的shape形状,都是相同长度的一维数组,即(12766,) (12766,) (12766,).
一、利用xyz绘制三维曲面
- fig = plt.figure()
- ax = fig.add_subplot(111, projection='3d')
- ax.plot_trisurf(x, y, z, color='white', edgecolors='grey', alpha=0.5) #绘制三角网格组成的三维曲面
- ax.scatter(x, y, z, c='red') # 绘制三维散点图
- plt.show()
复制代码 利用三角网格绘制的三维曲面图和三维散点图
二、利用xyz生成网格后绘制三维曲面
- fig = plt.figure()
- # ax = plt.axes(projection='3d')
- ax = fig.gca(projection='3d')
- surf = ax.plot_surface(xi, yi, zi, cmap='BuPu', linewidth=0, antialiased=True) #绘制三维曲面
- # surf = ax.scatter(xi, yi, zi, cmap='BuPu', linewidth=0, antialiased=True) #绘制三维散点图
- # surf = ax.contourf(xi, yi, zi, zdim='z',offset=0.3, cmap='BuPu') #等高线面图(contourf)或等高线图(contour),要设置offset,为Z的最小值,
- fig.colorbar(surf)
- ax.set_title('三维图')
- ax.set_zlim3d(np.min(z), np.max(z))
- plt.show()
复制代码 三维曲面图、散点图和等值线图
三、利用xyz实现三维等值线绘制,降雨量三维等值线图
- filename = r'D:\project\PythonProject\ECL\data\geochemical-data\0.txt' # 数据文件地址,附件1
- df = pd.read_csv(filename, sep="\t") # 读取文件
- df1 = df["1"] # 读取第一列数据
- df2 = df['2'] # 读取第二列数据
- df3 = df['3'] # 读取第三列数据
- odf1 = np.linspace(100, 1900, 50) # 设置网格经度
- odf2 = np.linspace(10, 600, 50) # 设置网格纬度
- odf1, odf2 = np.meshgrid(odf1, odf2) # 网格化,生成网络,生成网格形状是第一个维度对应odf1,第二个维度对应odf2
- func = Rbf(df1, df2,df3, function='linear') # 定义插值函数plt.cm.hot
- odf3_new = func(odf1, odf2) # 获得插值后的网格累计降水量
- fig = plt.figure(figsize=(12, 7))
- ax1 = plt.axes(projection='3d') # 创建三维坐标轴
- ax1.plot_surface(odf1, odf2, odf3_new,alpha=0.3,cmap='rainbow') #绘制三维曲面,alpha-控制透明度,cmap-控制颜色
- # 绘制z方向投影填充图,等高线面图,投到x-y平面,offset为z最小值。
- cs=plt.contourf(odf1, odf2, odf3_new,zdir='z',offset=0,
- levels=np.arange(odf3_new.min(), odf3_new.max(), (odf3_new.max() - odf3_new.min()) / 10), cmap='GnBu',
- extend='both') # 画图
- # 绘制等高线图
- line = plt.contour(odf1, odf2, odf3_new,zdir='z',offset=0,cmap="rainbow",levels=np.arange(odf3_new.min(), odf3_new.max(), (odf3_new.max() - odf3_new.min()) / 10))
- plt.clabel(line, inline=True, fontsize=12)
- ax1.set_title('降雨量三维等值线图')
- plt.colorbar(cs)
- plt.show()
复制代码 效果图和数据格式
四、绘制二维等值线
- # 绘制二维等值线
- levels = np.linspace(np.min(z), np.max(z), 50)
- fig, ax = plt.subplots(figsize=(8, 6))
- # # 1.设置颜色条 第一种方式
- # print(cm.colors.cnames)
- # 默认颜色标如 jet,coolwarm,gnuplot2_r,RdBu_r,PuBuGn_r,ocean_r,输入的颜色名称错误时,会自动输出色标的列表
- cmap = cm.get_cmap('seismic_r')
- # cmap = cm.get_cmap('jet', 10) # 将色条分成10截
- norm = cm.colors.Normalize(vmin=np.min(z), vmax=np.max(z)) # 设置色条表示的数值范围
- im1 = cm.ScalarMappable(norm=norm, cmap=cmap) # 设置映射很重要
- # # 绘制颜色条(left, bottom, width, height)--表示figure的百分比,从figure 从横向92%,纵向10%的位置开始绘制, 宽是figure的3%,高是figure的78%,
- ax9 = fig.add_axes([0.92, 0.1, 0.03, 0.78])
- cb = plt.colorbar(im1, cax=ax9, orientation='vertical', extend='neither') #纵向绘制,两端无箭头
- # ticks与norm对应
- # # cb = plt.colorbar(im1, cax=ax9, orientation='horizontal', extend='max', ticks=np.linspace(1900,2600, 51))
- # cs = ax.contour(xi, yi, zi, levels=levels, cmap=cmap) # 不存在颜色间隔分段,并指定颜色条
- # cs = ax.contour(xi, yi, zi, levels=levels,cmap='coolwarm') # 存在颜色间隔分段
- cs = ax.contourf(xi, yi, zi, levels=levels,cmap='jet',extend='neither') # 等值线填充
- ax.clabel(cs, inline=True, fontsize=6)
- ax.set_title('等高线图')
- plt.show()
- # # 2.设置颜色条 第二种方式
- # cs = ax.contourf(xi, yi, zi, levels=levels, cmap='jet', extend='neither') # 等值线填充,存在颜色间隔分段
- # # ax.clabel(cs, inline=True, fontsize=6)
- # ax.set_title('等高线图')
- # plt.colorbar(cs)
- # plt.show()
复制代码 两种二维等值线图
五、绘制矢量流线图
- # 1.矢量场流线图 样例
- # 0:5表示数组中数值所在的区间。100j表示划分的密度,值越大,图片越清晰
- Y1, X1 = np.mgrid[-5:5:1000j, -5:5:10j]
- # (X,Y)是一维numpy数组的等距网格,(U,V)参数匹配的是(X,Y)速率的二维numpy数组
- # U,V矩阵在维度上的行数必须等于Y的长度,列的数量必须匹配X的长度
- U = -1 - X1 ** 2 + Y1
- V = 1 + X1 - Y1 ** 2
- # 可视化矢量场
- # 矢量场中的种子点坐标
- seed_points = np.array([[-2, -1, 0, 1, 2, -1], [-2, -1, 0, 1, 2, 2]]) # 种子点
- # cs=plt.streamplot(X1, Y1, U, V,density=[0.5,1],color=U,cmap="autumn",linewidth=1,start_points=seed_points.T)
- cs = plt.streamplot(X1, Y1, U, V, color=U, cmap="Accent", linewidth=1)
- # plt.plot(seed_points[0], seed_points[1], "+", color="g") # 绘制折线图,使用marker属性标记
- plt.colorbar()
- plt.show()
- # 2.用实际数据进行绘制,UV如何计算得到,要根据不同的目的进行计算。
- U,V=vectorComputeUV(xi,yi,zi)
- cs = plt.streamplot(xi, yi, U, V, color=U, cmap="Accent", linewidth=1)
- # cs = plt.quiver(xi, yi, U, V)
- plt.colorbar()
- plt.show()
- # 计算矢量场的速度矢量
- def vectorComputeUV(xi,yi,zi):
- # U = np.log10((xi/10000)) - zi/1000
- # V = 1 + np.log10(yi/100000) - (zi/1000) ** 3
- U = -1 - (xi/10000) ** 2 + (yi/100000)
- V = 1 + (xi/10000) - (yi/100000) ** 2
- return U,V
复制代码 示例效果图和实际数据案例图
附录
1.scipy.interpolate.griddata参数说明- scipy.interpolate.griddata的参数说明如下插入非结构化D-D 数据 points: 具有形状 (n, D) 的浮点数的二维 ndarray,或具有形状 (n,) 的一维 ndarray 的长度 D 元组。 数据点坐标。 values: 浮点数或复数的ndarray,形状(n,) 数据值。 xi: 具有形状 (m, D) 或长度为 D 的 ndarray 元组的二维 ndarray 可广播到相同形状。 插入数据的点。 method: {‘linear’, ‘nearest’, ‘cubic’},可选 插值方法。之一 fill_value: 浮点数,可选 用于填充输入点凸包之外的请求点的值。如果未提供,则默认值为 nan 。此选项对‘nearest’ 方法无效。 rescale: 布尔型,可选 在执行插值之前将点重新缩放到单位立方体。如果某些输入维度具有不可比较的单位并且相差许多数量级,这将很有用。返回 ndarray 插值数组。
复制代码 2.streamplot()参数说明- matplotlib.pyplot.streamplot()参数说明如下: x,y:表示间距均匀的网格数据。 u,v:表示(x, y)速率的二维数组。 density:表示流线的密度,默认为1。 color:表示流线颜色。一般设置为U cmap:表示线条颜色系,一般有'Accent', 'Accent_r', 'Blues', 'Blues_r', 'BrBG', 'BrBG_r', 'BuGn', 'BuGn_r', 'BuPu', 'BuPu_r', 'CMRmap', 'CMRmap_r', 'Dark2', 'Dark2_r', 'GnBu', 'GnBu_r', 'Greens' linewidth:表示流线的宽度。 arrowsize:表示箭头的大小。 arrowstyle:表示箭头的类型。 minlength:表示流线的最小长度。 maxlength:表示流线的最大长度。
复制代码 以上就是利用python绘制二三维曲面和矢量流线图的详细内容,更多关于python二三维曲面和矢量流线图的资料请关注脚本之家其它相关文章!
来源:https://www.jb51.net/python/292022epc.htm
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